El expresidente Mel Zelaya, quien actualmente es el coordinador de Libre y también funge como asesor presidencial de su esposa la actual presidenta de Honduras, Xiomara Castro, fue señalado por narcotraficante Devis Leonel Rivera Maradiaga, excabecilla del Cartel Los Cachiros, quien señaló que se le entregó 500 mil dólares para permitir la operación al cartel en 2006.
También el ahora convicto Héctor Emilio Fernández, extraditado en 2015 a EE.UU conocido como “Don H”, también aseguró en el juicio que había entregado sobornos al expresidente. Cabe mencionar que ante dicho señalamientos, Zelaya se defendió e indicó que nunca recibió sobornos porque no nombró un ministro ni por el crimen organizado, ni por presiones de la embajada americana.