En 2003, la primera residencia que Juan Orlando adquirió fue en el 2003 en la colonia Rubén Darío de Tegucigalpa por un valor de un millón 200 mil lempiras, en 2006, Hernández compró una casa en la colonia Hato de Enmedio por un valor de 2 millones 448 mil lempiras. Antes de llegar a la silla presidencial, Hernández fungió como presidente del Poder Legislativo en el periodo presidencial de Porfirio Lobo Sosa en 2010, "fue entonces cuando el crecimiento acelerado de sus bienes inició. Ese mismo año compró otra casa en la colonia Tepeyac por 2 millones 177 mil lempiras".
En 2011, siendo presidente del Congreso Nacional, adquirió una segunda casa en el Hato de Enmedio, cuyo valor fue de 4 millones 931 lempiras. En 2013 justo antes de llegar a Casa Presidencial, obtuvo su casa de habitación en Villas Las Palmeras, San Ignacio, lugar donde fue arrestado el 14 de febrero. El valor de compra fue 5 millones 909 mil lempiras.
En 2019, le otorgaron a la empresa familiar Sersel, la renovación de 10 contratos por un monto de 13.2 millones de lempiras. Durante los dos períodos de Hernández en la presidencia obtuvo contratos de seguridad en beneficio de Sersel para oficinas de fondos estatales. En 2020, la empresa de Juan Orlando Hernández obtuvo tres contratos más por 7 millones 846 mil lempiras pagados con fondos de la Secretaría de Salud (Sesal), en marco del combate a la pandemia por covid-19 con un sistema de salud precario.
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